中国医学科学院阜外医院作为国家级三级甲等心血管专科医院，是世界上最大的心脏病诊治中心、国家心血管病中心（卫生部心血管病防治研究中心）、国家级心血管病医疗·科研·预防和人才培养的重要基地。中国医学科学院阜外医院院史馆通过对医院历史、医院文化、医院科研成果、医院教育、国内外心血管学术知识展示，以期建立一所具有学术性、知识性、文化性、专属特色性与体验感并重的医院历史文化综合博物馆。